Ошибка если не выбран combobox

Проблема заключается в том, что в вашем ComboBox ничего не выбрано. Вы создаете свою форму, а затем, без предварительного взаимодействия с пользователем, вы хотите получить SelectedItem, который в данный момент равен нулю.

Когда вы создаете элемент управления ComboBox и заполняете его элементами, свойство SelectedItem равно null, пока вы не запрограммируете его программно (используя, например, comboBox1.SelectedIndex = 3), или пользовательское взаимодействие с элементом управления. В этом случае вы ничего не делаете из вышеперечисленного, и именно поэтому вы получаете указанную ошибку.

EDIT Основываясь на отредактированном вопросе
Измените свой код следующим образом:
сначала измените метод saveProfile, чтобы вы могли передать четыре строки, которые вы пишете в текстовый файл. Обратите внимание, что вы можете альтернативно передать ссылку формы, но я бы не предложил вам это. Поэтому измените метод следующим образом:

public void saveProfile(string filename, string cpuCount, string RAM , string VRAM , string threads)
    {
        string path = folder + "/" + filename;
        using(StreamWriter sw = new StreamWriter(path)) 
        {
             sw.WriteLine("cpuCount=" + cpuCount);
             sw.WriteLine("maxRAM=" + RAM );
             sw.WriteLine("maxVRAM=" + VRAM );
             sw.WriteLine("cpuThreads=" + threads);
        }        
    }

И затем вызовите его из кнопки3 Обработчик события Click следующим образом:

private void button3_Click(object sender, EventArgs e)
{
            string current = profile.currentProfile();
            string cpuCount = this.comboBox1.SelectedItem.ToString();
            string RAM =  this.comboBox4.SelectedItem.ToString();
            string VRAM = this.comboBox2.SelectedItem.ToString();
            string threads = this.comboBox3.SelectedItem().ToString();
            profile.saveProfile(current, cpuCount, RAM, VRAM, threads);
}

Или, альтернативно,

private void button3_Click(object sender, EventArgs e)
{
            string current = profile.currentProfile();
            profile.saveProfile(current, this.comboBox1.SelectedItem.ToString(), this.comboBox4.SelectedItem.ToString(), this.comboBox2.SelectedItem.ToString(), this.comboBox3.SelectedItem().ToString());
}

Проблема в том, что ничего не выбрано в вашем ComboBox, Вы создаете свою форму, а затем, без предварительного взаимодействия с пользователем, вы хотите получить SelectedItem который является нулевым в тот момент.

Когда вы создаете элемент управления ComboBox и заполняете его элементами, SelectedItem свойство null пока вы не установите его программно (например, используя comboBox1.SelectedIndex = 3) или путем взаимодействия с пользователем. В этом случае вы не делаете ничего из вышеперечисленного, и именно поэтому вы получаете упомянутую ошибку.

РЕДАКТИРОВАТЬ На основе отредактированного вопроса Измените свой код следующим образом: сначала измените saveProfile метод, чтобы вы могли передать четыре строки, которые вы пишете в текстовом файле. Обратите внимание, что вы могли бы альтернативно передать ссылку на форму, но я бы не советовал вам этого. Так что измените метод следующим образом:

public void saveProfile(string filename, string cpuCount, string RAM , string VRAM , string threads)
    {
        string path = folder + "/" + filename;
        using(StreamWriter sw = new StreamWriter(path)) 
        {
             sw.WriteLine("cpuCount=" + cpuCount);
             sw.WriteLine("maxRAM=" + RAM );
             sw.WriteLine("maxVRAM=" + VRAM );
             sw.WriteLine("cpuThreads=" + threads);
        }        
    }

А затем вызовите его из обработчика события button3 Click следующим образом:

private void button3_Click(object sender, EventArgs e)
{
            string current = profile.currentProfile();
            string cpuCount = this.comboBox1.SelectedItem.ToString();
            string RAM =  this.comboBox4.SelectedItem.ToString();
            string VRAM = this.comboBox2.SelectedItem.ToString();
            string threads = this.comboBox3.SelectedItem().ToString();
            profile.saveProfile(current, cpuCount, RAM, VRAM, threads);
}

Или в качестве альтернативы

private void button3_Click(object sender, EventArgs e)
{
            string current = profile.currentProfile();
            profile.saveProfile(current, this.comboBox1.SelectedItem.ToString(), this.comboBox4.SelectedItem.ToString(), this.comboBox2.SelectedItem.ToString(), this.comboBox3.SelectedItem().ToString());
}